洁净室按空气清洁程度分类，如果无尘室的等级只用尘粒数目来叙述，则可假设尘粒的尺寸为0.5μm，例如，1级、10级、例如100级无尘室尘埃粒子数目分别小于或等于1颗、10颗、100颗。如果尘粒尺寸不是0.5μm，无尘室等级应以在一特定尘粒尺寸的级数来表示，分别分为1级、10级、100级、1000级、10000级、100000级，数值越小，净化级别就越高。洁净度越高造价就越高。
洁净室是指将一定空间范围内之空气中的微粒子、有害空气、等之污染物排除,并将室内之温度、洁净度、室内压力、气流速度与气流分布、噪音振动及照明、静电控制在某一需求范围内,而所给予特别设计之房间。亦即是不论外在之空气条件如何变化,其室内均能俱有维持原先所设定要求之洁净度、温湿度及压力等性能之特性。
万级无菌室有足够的存储空间摆放物品以方便使用。在实验室工作区域处还有供长期使用的存储空间。在实验室的工作区域处应有存放个人衣物的条件。在实验室所有的建筑内配备高压蒸汽自净器，并按期检查和验证，以保证符合要求。
在实验室内配备生物柜。设洗眼设施，必要时应有应急喷淋装置。考虑机械通风，如使用窗户自然通风，有防虫纱窗。有可靠的电力供应和应急照明。必要时，重要设备如培养箱、生物柜、冰箱等应设备用电源。实验室出口有在黑暗是可明确辨认的标识。